A múzeumbuszok hét különböző útvonalon közlekednek majd a helyszínek között, és akinek a rendezvényre szóló karszalagja van, ingyen felszállhat a járművekre. A járatok a következők, melyek pontos menetrendjét itt lehet megtekinteni:
- MU1: Észak-pesti járat
- MU2: Budai járat
- MU3: Dél-pesti járat
- MU4: Budafoki (Törley) járat
- MU5: Óbudai járat
- MU6: Budavári járat
- MU7: Várkert Bazár járat
Mivel szinte az összes részt vevő múzeum a belvárosban vagy a környékén található, és mindegyik közelében található MOL Bubi gyűjtőállomás, ezért a közösségi kerékpárokkal is vándorolhatunk a helyszínek között. A BKK, a BKV Zrt. és a Közlekedési Múzeum együttműködésében június 24-én, szombat délutántól nosztalgiavillamossal is utazhatunk. Az 1979-ig aktív szolgálatot teljesítő egykori budapesti villamos nemrég lett felújítva, és az 1940-es évek hangulatát idézi. A Keleti pályaudvar és a kőbányai Kápolna utca között közlekedik majd a nosztalgiajárat, ami az Északi Járműjavítót, vagyis a Közlekedési Múzeumot is érinti. A másik múltidéző járat a Keleti pályaudvar és a Jászai Mari tér között körjáratként közlekedő nosztalgiatroli lesz, amivel a Múzeumok Éjszakája során több részt vevő intézményt is elérhetünk.